Junos CLI là giao diện lệnh để cấu hình, khắc phục sự cố và giám sát thiết bị Juniper và lưu lượng mạng. Nó hỗ trợ hai loại chế độ lệnh.[12]

• Chế độ hoạt động
• Chế độ cấu hình

Các chức năng của Chế độ hoạt động bao gồm kiểm soát môi trường dòng lệnh CLI, theo dõi trạng thái phần cứng và hiển thị thông tin về dữ liệu mạng.

Chế độ Cấu hình được sử dụng để cấu hình bộ định tuyến, bộ chuyển mạch hoặc thiết bị bảo mật Juniper, bằng cách thêm, xóa hoặc sửa đổi các câu lệnh trong cấu hình.